Firefly
Универсальный высокопроизводительный некоммерческий программный пакет, разрабатываемый на химическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова на протяжении более 20 лет
Поддержка методов расчета электронной структуры на разных уровнях теории
От базовых методов функционала плотности DFT до многореференсных подходов, включая уникальные разработки, такие как многоконфигурационная квазивырожденная теория возмущений второго порядка XMCQDPT2
Моделирование молекулярных систем в конденсированной фазе
С использованием модели поляризующегося континуума (PCM) и гибридного метода эффективных фрагментов (EFP)
Учет релятивистских эффектов в расчетах с “тяжелыми” элементами
В расчетах с “тяжелыми” элементами с использованием эффективных остовных потенциалов (ECP)
Моделирование биологически значимых систем
Комбинированные методы квантовой и молекулярной механики в сочетании с эффективными алгоритмами оптимизации геометрии, поиска переходных состояний и расчета колебательных частот делает Firefly мощным инструментом для моделирования структуры, реакционной способности и спектральных свойств биомолекул
Моделирование электронно-возбужденных молекул и фотохимических реакций
С помощью эффективно реализованного метода XMCQDPT2
Экстремальная производительность
Предусмотрены возможности параллелизации для большинства алгоритмов с использованием методов LAPACK и BLAS третьего уровня, что позволяет производить вычисления на кластерах и суперкомпьютерах
Кроссплатформенность
Поддержка основных операционных систем Linux и Windows, обеспечивающая гибкость развертывания на различных вычислительных ресурсах
Число зарегистрированных пользователей пакета превышает 5000. По числу пользователей Firefly лидирует Япония, за которой следуют Китай и Индия, остальные страны юго-восточной Азии, Европа и Америка. Пакет широко используется как в университетах и колледжах, так и в высокотехнологичных компаниях.
Firefly востребован благодаря своей гибкости, высокой производительности и бесплатной лицензии, что делает его универсальным инструментом для решения научных и промышленных задач.
Предоставляет возможность создания и визуализации молекулярных структур, ускоряя процесс создания входных файлов, упрощая запуск расчетов на кластерах и суперкомпьютерах, а также позволяя проводить анализ полученных результатов
Granovsky, Alexander A.
In: The Journal of Chemical Physics, vol. 143, no. 23, pp. 231101, 2015, ISSN: 0021-9606.
@article{Granovsky2015,
title = {Communication: An efficient approach to compute state-specific nuclear gradients for a generic state-averaged multi-configuration self consistent field wavefunction},
author = {Alexander A. Granovsky},
url = {https://doi.org/10.1063/1.4938169},
doi = {10.1063/1.4938169},
issn = {0021-9606},
year = {2015},
date = {2015-01-01},
journal = {The Journal of Chemical Physics},
volume = {143},
number = {23},
pages = {231101},
keywords = {},
pubstate = {published},
tppubtype = {article}
}
Moreno, J.; Gerecke, M.; Dobryakov, A. L.; Ioffe, I. N.; Granovsky, A. A.; Bléger, D.; Hecht, S.; Kovalenko, S. A.
Two-Photon-Induced versus One-Photon-Induced Isomerization Dynamics of a Bistable Azobenzene Derivative in Solution Journal Article
In: The Journal of Physical Chemistry B, vol. 119, no. 37, pp. 12281-12288, 2015.
@article{Moreno2015,
title = {Two-Photon-Induced versus One-Photon-Induced Isomerization Dynamics of a Bistable Azobenzene Derivative in Solution},
author = {J. Moreno and M. Gerecke and A. L. Dobryakov and I. N. Ioffe and A. A. Granovsky and D. Bléger and S. Hecht and S. A. Kovalenko},
doi = {10.1021/acs.jpcb.5b07008},
year = {2015},
date = {2015-01-01},
journal = {The Journal of Physical Chemistry B},
volume = {119},
number = {37},
pages = {12281-12288},
keywords = {},
pubstate = {published},
tppubtype = {article}
}
Vegh, Russell B.; Bloch, Dmitry A.; Bommarius, Andreas S.; Verkhovsky, Michael; Pletnev, Sergei; Iwaï, Hideo; Bochenkova, Anastasia V.; Solntsev, Kyril M.
Hidden photoinduced reactivity of the blue fluorescent protein mKalama1 Journal Article
In: Phys. Chem. Chem. Phys., vol. 17, iss. 19, pp. 12472-12485, 2015.
@article{Russell2015,
title = {Hidden photoinduced reactivity of the blue fluorescent protein mKalama1},
author = {Russell B. Vegh and Dmitry A. Bloch and Andreas S. Bommarius and Michael Verkhovsky and Sergei Pletnev and Hideo Iwaï and Anastasia V. Bochenkova and Kyril M. Solntsev},
url = {http://dx.doi.org/10.1039/C5CP00887E},
doi = {10.1039/C5CP00887E},
year = {2015},
date = {2015-01-01},
journal = {Phys. Chem. Chem. Phys.},
volume = {17},
issue = {19},
pages = {12472-12485},
publisher = {The Royal Society of Chemistry},
keywords = {},
pubstate = {published},
tppubtype = {article}
}
Quick, M.; Dobryakov, A. L.; Gerecke, M.; Richter, C.; Berndt, F.; Ioffe, I. N.; Granovsky, A. A.; Mahrwald, R.; Ernsting, N. P.; Kovalenko, S. A.
Photoisomerization Dynamics and Pathways of trans- and cis-Azobenzene in Solution from Broadband Femtosecond Spectroscopies and Calculations Journal Article
In: The Journal of Physical Chemistry B, vol. 118, no. 29, pp. 8756-8771, 2014.
@article{Quick2014,
title = {Photoisomerization Dynamics and Pathways of trans- and cis-Azobenzene in Solution from Broadband Femtosecond Spectroscopies and Calculations},
author = {M. Quick and A. L. Dobryakov and M. Gerecke and C. Richter and F. Berndt and I. N. Ioffe and A. A. Granovsky and R. Mahrwald and N. P. Ernsting and S. A. Kovalenko},
doi = {10.1021/jp504999f},
year = {2014},
date = {2014-01-01},
journal = {The Journal of Physical Chemistry B},
volume = {118},
number = {29},
pages = {8756-8771},
keywords = {},
pubstate = {published},
tppubtype = {article}
}
Gozem, Samer; Melaccio, Federico; Valentini, Alessio; Filatov, Michael; Huix-Rotllant, Miquel; Ferré, Nicolas; Frutos, Luis Manuel; Angeli, Celestino; Krylov, Anna I.; Granovsky, Alexander A.; Lindh, Roland; Olivucci, Massimo
Shape of Multireference, Equation-of-Motion Coupled-Cluster, and Density Functional Theory Potential Energy Surfaces at a Conical Intersection Journal Article
In: Journal of Chemical Theory and Computation, vol. 10, no. 8, pp. 3074-3084, 2014.
@article{Gozem2014,
title = {Shape of Multireference, Equation-of-Motion Coupled-Cluster, and Density Functional Theory Potential Energy Surfaces at a Conical Intersection},
author = {Samer Gozem and Federico Melaccio and Alessio Valentini and Michael Filatov and Miquel Huix-Rotllant and Nicolas Ferré and Luis Manuel Frutos and Celestino Angeli and Anna I. Krylov and Alexander A. Granovsky and Roland Lindh and Massimo Olivucci},
doi = {10.1021/ct500154k},
year = {2014},
date = {2014-01-01},
journal = {Journal of Chemical Theory and Computation},
volume = {10},
number = {8},
pages = {3074-3084},
keywords = {},
pubstate = {published},
tppubtype = {article}
}
Sorry, no publications matched your criteria.