Qphorus.ru

Firefly

Универсальный высокопроизводительный некоммерческий программный пакет, разрабатываемый на химическом факультете МГУ имени М.В. Ломоносова ​​на протяжении более 20 лет

image
Ключевые функциональные возможности пакета

Поддержка методов расчета электронной структуры на разных уровнях теории

От базовых методов функционала плотности DFT до многореференсных подходов, включая уникальные разработки, такие как многоконфигурационная квазивырожденная теория возмущений второго порядка XMCQDPT2

Моделирование молекулярных систем в конденсированной фазе

С использованием модели поляризующегося континуума (PCM) и гибридного метода эффективных фрагментов (EFP)

Учет релятивистских эффектов в расчетах с “тяжелыми” элементами

В расчетах с “тяжелыми” элементами с использованием эффективных остовных потенциалов (ECP)

Моделирование биологически значимых систем

Комбинированные методы квантовой и молекулярной механики в сочетании с эффективными алгоритмами оптимизации геометрии, поиска переходных состояний и расчета колебательных частот делает Firefly мощным инструментом для моделирования структуры, реакционной способности и спектральных свойств биомолекул

Моделирование электронно-возбужденных молекул и фотохимических реакций

С помощью эффективно реализованного метода XMCQDPT2

Экстремальная производительность

Предусмотрены возможности параллелизации для большинства алгоритмов с использованием методов LAPACK и BLAS третьего уровня, что позволяет производить вычисления на кластерах и суперкомпьютерах

Кроссплатформенность

Поддержка основных операционных систем Linux и Windows, обеспечивающая гибкость развертывания на различных вычислительных ресурсах

Firefly широко используется как в России, так и за рубежом

Число зарегистрированных пользователей пакета превышает 5000. По числу пользователей Firefly лидирует Япония, за которой следуют Китай и Индия, остальные страны юго-восточной Азии, Европа и Америка. Пакет широко используется как в университетах и колледжах, так и в высокотехнологичных компаниях.

Firefly востребован благодаря своей гибкости, высокой производительности и бесплатной лицензии, что делает его универсальным инструментом для решения научных и промышленных задач.

Предоставляет возможность создания и визуализации молекулярных структур, ускоряя процесс создания входных файлов, упрощая запуск расчетов на кластерах и суперкомпьютерах, а также позволяя проводить анализ полученных результатов

image
Избранные публикации
39 entries « 2 of 8 »
6.

Aslopovsky, Vladislav R.; Scherbinin, Andrei V.; Kleshchina, Nadezhda N.; Bochenkova, Anastasia V.

Impact of the Protein Environment on Two-Photon Absorption Cross-Sections of the GFP Chromophore Anion Resolved at the XMCQDPT2 Level of Theory Journal Article

In: International Journal of Molecular Sciences, vol. 24, no. 14, 2023, ISSN: 1422-0067.

Links | BibTeX

7.

Andersen, Lars H.; Rasmussen, Anne P.; Pedersen, Henrik B.; Beletsan, Oleg B.; Bochenkova, Anastasia V.

High-Resolution Spectroscopy and Selective Photoresponse of Cryogenically Cooled Green Fluorescent Protein Chromophore Anions Journal Article

In: The Journal of Physical Chemistry Letters, vol. 14, no. 28, pp. 6395-6401, 2023.

Links | BibTeX

8.

Sudarkova, Svetlana M.; Ioffe, Ilya N.

E/Z photoisomerization pathway in pristine and fluorinated di(3-furyl)ethenes Journal Article

In: Phys. Chem. Chem. Phys., vol. 24, iss. 38, pp. 23749-23757, 2022.

Links | BibTeX

9.

Gruber, Elisabeth; Kabylda, Adil M.; Nielsen, Mogens Brøndsted; Rasmussen, Anne P.; Teiwes, Ricky; Kusochek, Pavel A.; Bochenkova, Anastasia V.; Andersen, Lars H.

Light Driven Ultrafast Bioinspired Molecular Motors: Steering and Accelerating Photoisomerization Dynamics of Retinal Journal Article

In: Journal of the American Chemical Society, vol. 144, no. 1, pp. 69-73, 2022.

Links | BibTeX

10.

Tau, Omri; Henley, Alice; Boichenko, Anton N; Kleshchina, Nadezhda N; Riley, River; Wang, Bingxing; Winning, Danielle; Lewin, Ross; Parkin, Ivan P; Ward, John M; others,

Liquid-microjet photoelectron spectroscopy of the green fluorescent protein chromophore Journal Article

In: Nature communications, vol. 13, no. 1, pp. 507, 2022.

BibTeX

39 entries « 2 of 8 »

Sorry, no publications matched your criteria.